Felipe Aguilera

Profesor Asistente
Biólogo Marino, Universidad de Valparaíso, Chile.
Doctor of Philosophy, mención en Biología Evolutiva y Bioinformática, The University of Queensland, Australia.
Postdoctorado School of Biological Sciences, The University of Queensland, Australia.
Postdoctorado Sars International Centre for Marine Molecular Biology, University of Bergen, Noruega.

Edificio Biología Molecular, 1er Piso. Departamento de Bioquímica y Biología Molecular.
(+56-41) 220-3790
faguilera@udec.cl

Pregrado

  • Bioinformática, Genómica y Evolución Molecular, Carrera de Bioingeniería. Profesor colaborador.

Postgrado

  • Bioinformática y Genómica Avanzada, Programa de Magister en Bioquímica y Bioinformática. Profesor colaborador.

Líneas de Investigación

Soy biólogo marino de profesión con un gran interés en los mecanismos genómicos, moleculares y celulares que sustentan la formación, evolución y funcionamiento de los animales. Mis estudios actuales y anteriores abarcan una amplia gama de animales marinos, algunos de cuales tienen un alto valor económico y otros que actúan como modelos para abordar preguntas fundamentales en biología, desarrollo embrionario, evolución y biomedicina. Mi línea de investigación no se basa en los clásicos organismos modelos (ratón, pez cebra, Drosophila, Xenopus), sino que trabajamos con una amplia gama de invertebrados marinos tales como erizos de mar, moluscos, platelmintos, cnidarios y esponjas – solo por nombrar algunos. En mi investigación, utilizo técnicas modernas de biología molecular (e.j., aislamiento de genes, hibridaciones in situ, microscopia confocal), así como también técnicas ómicas (e.j., genómica, transcriptómica, epigenómica y proteómica) en conjunto con enfoques de bioinformática y biología computacional para responder preguntas biológicas en las siguientes áreas:

  1. Genómica funcional y evolución de la biomineralización.
  2. Genómica del desarrollo y evolución de los tipos de células, tejidos y órganos.
  3. Evolución de genomas y adaptación de organismos multicelulares.
  4. Invertebrados marinos y su aplicación en biotecnología y biomedicina.

Estas líneas de investigación se están llevando a cabo en colaboración con los siguientes investigadores internacionales y nacionales:

Colaboradores Internacionales:

  • Bernie Degnan, The University of Queensland, Australia.
  • Selene Fernandez-Valverde, LANGEBIO, México.
  • Andreas Hejnol, University of Bergen, Noruega.
  • Daniel Jackson, Unviersity of Göttingen, Alemania.
  • Kevin Kocot, University of Alabama, Estados Unidos.
  • Fabiola Lafarga-De la Cruz, CICESE, México.
  • Carmel McDougall, Griffith University, Australia.
  • Joong-ki Park, Ewha Womans University, Corea del Sur.
  • Oleg Simakov, University of Vienna, Austria.

Colaboradores Nacionales:

  • Víctor Faúndez, Universidad Católica de la Santísima Concepción.
  • Gloria González, Universidad Católica del Maule.
  • Marcela Torrejón, Universidad de Concepción.
  • Sylvain Marcellini, Universidad de Concepción.

Proyectos

  • Proyecto PAI Inserción en la Academia (79170033): Genómica comparativa y funcional aplicada al estudio y la evolución de la biomineralización en animales. Investigador Responsable. Marzo 2018 – Febrero 2021.
  • ERC Consolidator Grant (648861): EVOMESODERM: The evolution of mesoderm and its differentiation into cell types and organ systems. Colaborador Internacional. Junio 2015 – Mayo 2020.

Publicaciones (últimos 5 años)

  • Thiel D, Franz-Wachtel M, Aguilera F, & Hejnol A. 2018. Xenacoelomorph neuropeptidomes reveal a major expansion of neuropeptide systems during early bilaterian evolution. Molecular Biology and Evolution https://doi.org/10.1093/molbev/msy160
  • Fernandez-Valverde SL*, Aguilera F*, & Ramoz-Diaz RA. 2018. Inference of developmental gene regulatory networks beyond classical model systems: new approaches in the post-genomic era. Integrative and Comparative Biology: DOI: https://doi.org/10.1093/icb/icy061 (*These authors are corresponding authors).
  • Martínez-Matus E*, Aguilera F*, Knibb W, Sepulveda FA, Gonzalez MT, Farfan C & Lafarga-De la Cruz F. 2018. Population genetics of Seriola lalandi confirms hemisphere separation structure and reveals a new population subdivision in the South Pacific. Ecology and Evolution. (Submitted) (*These authors contributed equally)
  • Gonzalez G*, Aguilera F*, & Valenzuela M. 2018. Transcriptome profiling of raspberry (Rubus idaeus Amira) in response to infection by Tomato RingSpot Virus (ToRSV). PLoS ONE. (Accepted) (*These authors contributed equally)
  • Aguilera F*. Neoplasia in mollusks: What does it tell us about cancer in humans? A Review. Journal of Genetic Disorders 1:7. (Corresponding author)
  • Lim DKY, Schuhmann H, Thomas-Hall SR, Chan KCK, Wass JT, Aguilera F, Adarme-Vega CT, Dal’Molin CGO, Thorpe GJ, Batley J, Edwards D, & Schenk PM. 2017. RNA-Seq and metabolic flux analysis of Tetraselmis M8 during nitrogen starvation reveals a two-stage lipid accumulation mechanism. Bioresource Technology 244:1281-1293.
  • Aguilera F, McDougall C, & Degnan BM. 2017. Co-option and de novo gene evolution underlie molluscan shell diversity. Molecular Biology and Evolution 34:779-792.
  • Kocot KM*, Aguilera F*, McDougall C, Jackson DJ, & Degnan BM. 2016. Sea shell diversity and rapidly evolving secretomes: insights into the evolution of biomineralization. Frontiers in Zoology 13:23. (*These authors contributed equally)
  • Aguilera F, McDougall C, & Degnan BM. 2014. Evolution of the tyrosinase gene family in bivalve molluscs: independent expansion of the mantle gene repertoire. Acta Biomateralia 10:3855-3865.
  • McDougall C, Aguilera F, Moase P, Lucas JS, & Degnan BM. 2013. Pearls. Current Biology 23:R671-R673.
  • Aguilera F, McDougall C, & Degnan BM. 2013. Origin, evolution and classification of type-3 copper proteins: lineage-specific gene expansions and losses across the Metazoa. BMC Evolutionary Biology 13:96. (Highly accessed)
  • McDougall C, Aguilera F, & Degnan BM. 2013. Rapid evolution of pearl oyster proteins with repetitive, low-complexity domains. Journal of the Royal Society Interface 10:20130041. (Cover image)

Laboratorio

Laboratorio de Genómica Marina, Desarrollo y Evolución

Investigador Principal: Dr. Felipe Aguilera

ResearchGate: https://www.researchgate.net/profile/Felipe_Aguilera2

GoogleScholar: https://scholar.google.com.au/citations?user=fUYk__wAAAAJ&hl=en

Twitter: @faguilgen