Amparo Uribe

Elena Amparo Uribe

Profesora Asociada
Doctor en Ciencias Biológicas, Universidad de Concepción.

Edificio Biología Molecular 1er Piso. Departamento de Bioquímica y Biología Molecular
(+56-41) 220-7390
(+56-2) 
auribe@udec.cl
Laboratorio de Enzimología

Docencia

En docencia de pregrado: Áreas de proteínas-enzimas y metabolismo para cursos de Bioquímica dictados para las carreras de Medicina,Enfermería, Pedagogía en Biología, Pedagogía en Química, Agronomía,  Biotecnología Marina y Acuicultura y Kinesiología.
Para Postgrado: Curso de Enzimología para el Magíster en Bioquímica y Bioinformática, dirección de Unidades de Investigación y Seminarios Bibliográficos en el Doctorado en Ciencias Biológicas mención Biología Celular y Molecular y en el Magíster en Bioquímica y Bioinformática.

Líneas de Investigación

El Laboratorio de Enzimología del Departamento de Bioquímica y Biología Molecular de la Universidad de Concepción, actualmente está dedicado al estudio de las enzimas involucradas en el catabolismo de agmatina en mamíferos. Esta molécula es una amina que se genera producto de la descarboxilación del aminoácido arginina y que cumple funciones relevantes en mamíferos especialmente en humanos. Entre estas funciones destacan: neurotransmisor, neuromodulador, regulador de la liberación de insulina in vitro, inhibidor de las óxido nítrico sintasas, regulador de la excreción renal de sodio, entre otras. A nivel farmacológico, agmatina potencia la analgesia generada por morfina, tiene acciones anticonvulsionantes y ansiolíticas, y en ensayos con animales se ha visto que es favorable en el tratamiento de la enfermedad de Parkinson’s, Alzheimer’s y epilepsia. Nuestro laboratorio ha clonada varias isoformas de enzimas de cerebro de rata capaces de hidrolizar la agmatina en putrescina y urea, y de esta manera regular los niveles de este metabolito en cerebro. Se ha identificado directamente la expresión de estas enzimas en cerebro de rata. Se han caracterizado dominios reguladores y residuos que unen iones metálicos esenciales para la actividad catalítica. Se está trabajando en la identificación de posibles proteínas interactoras con estas enzimas en cerebro. Actualmente, estas son las únicas enzimas de mamíferos conocidas capaces de degradar la agmatina en mamíferos. Adicionalmente, estudiamos genes relacionados de humano y ratón. Empleamos metodologías de clonamiento, mutagénesis sitiodirigida, purificación de proteínas, expresión de proteínas recombinantes en sistemas bacterianos y de levaduras, aislamiento de complejos multiproteicos desde cultivo de células de mamíferos, caracterización cinética de proteínas nativas y recombinantes, determinación del contenido metálico de enzimas purificadas entre otras.

Proyectos

Investigador responsable del Proyecto Enlace-VRID 215.037.019-1.0, titulado “Análisis funcional de la proteína LIMCH1: clonamiento, expresión y caracterización de las isoformas I y II”, con duración de dos años, 2015-2016.
Co-investigador en proyecto Fondecyt 1140677 tiyulado: Role of tanycytes in feeding behavior, con duración de cuatro años, 2014 – 2018.
Investigador en proyecto INNOVA CHILE14IDL2-30150 titulado: Producción de un bioadhesivo de origen marino para uso en superficies húmedas. Aplicaciones Odontológicas. 2015-2016.

Publicaciones

  1. García, D. Ordenes, P. Benítez, J. González, A. García-Robles, M. López, V. Carvajal, N. Uribe, E. Cloning of two LIMCH1 isoforms: characterization of their distribution in rat brain and their agmatinase activity. Histochemstry and Cell Biology, 145:305-313, 2016.
  2. Quiñones M, Cofre J, Benítez J, García D, Romero N, González A, Carvajal N, García M, López V, Schenk G, Uribe E. Insight on the interaction of an agmatinase-like protein with Mn(2+) activator ions. J Inorg Biochem. 2015, 145:65-9.
  3. García D, Uribe E, Salgado M, Martínez MP, Carvajal N. Mutagenic and kinetic support for an allosteric site in arginase from the extreme thermophile Bacillus caldovelox, which allows activation by arginine. Biochimie. 108:8-12, 2015.
  4. Mitić, M. Miraula, C. Selleck, K.S. Hadler, E. Uribe, M.M. Pedroso, G. Schenk. Catalytic mechanisms of metallohydrolases containing two metal ions.   AProtein Chem Struct Biol. 97:49-81. 2014.
  5. Cofre M, Montes P, Vallejos A, Benítez J, García D, Martínez-Oyanedel J, Carvajal N, Uribe E. Further insight into the inhibitory action of a LIM/double zinc-finger motif of anagmatinase-like protein. Journal of Inorganic Biochemistry 132:92-95, 2014.
  6. Salgado M, Tarifeño-Saldivia E, Ordenes P, Millán C2, Yañez MJ, Llanos P, Villagra M, Elizondo-Vega R, Martínez F, Nualart F, Uribe E, María de Los Angeles García-Robles M.  Dynamic localization of glucokinase and its regulatory protein in hypothalamic tanycytes. PlosOne. 9:94035-10137, 2014.
  7. Castro V, Fuentealba P, Henríquez A, Vallejos A, Benítez J, Lobos M, Díaz B, Carvajal N, Uribe E. Evidence for an inhibitory LIM domain in a rat brain agmatinase-like protein. Arch Biochem Biophys. 512:107-10, 2011.
  8. Fuentealba González P, Llanos-Rivera A, Carvajal Baeza N, Uribe Pérez E. Xenobiotic-induced changes in the arginase activity of zebrafish (Danio rerio) eleutheroembryo. Environ Toxicol Chem. 30:2285 – 91, 2011
  9. Mella, C., Martínez, F., García, M., Nualart, F., Castro, V., Bustos, P., Carvajal, N., Uribe, E. Expression and localization of agmatinase-like protein in the rat brain. Histochemistry and Cell Biology 124:137-144, 2010.
  10. García, D., Uribe E., Lobos M., Orellana MS., Carvajal N. Studies on the functional significance of a C-terminal S-shaped motif in human arginase type I: Essentiality for cooperative effects. Arch Biochem Biophys. 481.16-20, 2009.
  11. Uribe, E., Salas, M, Enriquez, S., Orellana, MS, Carvajal, N. Cloning and functional expression of a rodent brain cDNA encoding a novel protein with agmatinase activity, but not belonging to the arginase family. Arch. Biochem. Biophys. 461:146-150. 2007.
  12. Alarcón, R., Orellana, M.S., Neira, B., Uribe, E., García, J., Carvajal, N. (2006) Mutational análisis of substrate recongnition by human arginase type I: Agmatinase activity of the N130D variant. FEBS Journal 273:5625-5631.
  13. Bascuñan-Godoy, L., Uribe, E., Zuñiga-Feest, A., Corcuera, L., Bravo, L.(2006) Low temperature regulates sucrose-phosphate synthase activity in Colobanthus quitensis (Kunth) Bartl by decreasing its sensitivity to Pi and increased activation by Gluc-6-P.Polar Biology.29:1011-1017.
  14. Lopez V, Alarcon R, Orellana MS, Enriquez P, Uribe E, Martinez J, Carvajal N. (2005) Insights into the interaction of human arginase II with substrate and manganese ions by site-directed mutagenesis and kinetic studies. Alteration of substrate specificity by replacement of Asn149 with Asp. FEBS J. 272(17):4540-4548
  15. Salas M, Lopez V, Uribe E, Carvajal N. (2004) Studies on the interaction of Escherichia coli agmatinase with manganese ions: structural and kinetic studies of the H126N and H151N variants. J Inorg Biochem. 98:1032-1036.
  16. Carvajal N, Uribe E, Lopez V, Salas M (2004).  Inactivation of human liver arginase by Woodward’s reagent K: evidence for reaction with His141. Protein J. 23:179-183.
  17. Carvajal N, Orellana MS, Borquez J, Uribe E, Lopez V, Salas M. (2004)Non-chelating inhibition of the H101N variant of human liver arginase by EDTA. J Inorg Biochem. 98:1465-1469.
  18. Carvajal N, Orellana MS, Salas M, Enriquez P, Alarcon R, Uribe E, Lopez V. (2004) Kinetic studies and site-directed mutagenesis of Escherichia coli agmatinase. A role for Glu274 in binding and correct positioning of the substrate guanidinium group. Arch Biochem Biophys. 430:185-190.
  19. Salas, M., Rodriguez, R., Uribe,E., López,V., Fuentes,M., López,N., and Carvajal,N.(2002) Insights into the reaction mechanism of Escherichia coli agmatinase by site directed mutagenesis and molecular modelling. A critical role for aspartate 153.  European Journal of Biochemistry 269: 5522-5526.
  20. Orellana, M. S., López,V., Uribe, E., Fuentes, M., Salas, M., and Carvajal, N., (2002) Insights into the interaction of human liver arginase with tighly and weakly bound manganese ions by chemical modification and site-directed mutagenesis studies. Archives of Biochemistry and Biophysics 403:155-159.
  21. Carvajal, N., López, V., Salas, M., Uribe, E., Herrera, P., Cerpa, J. (1999) Manganese is essential for catalytic activity of Escherichia coli agmatinase. Biochem. Biophys. Res. Commun. 258(3):808-11.
  22. Carvajal, N., Salas, M., López, V., Uribe, E., Herrera, P., Cerpa, J., Fuentes, M. (1999) Manganese-dependent inhibition of human liver arginase by borate. J. inor. Biochem. 77,163-167.
  23. Carvajal, N., Olate, J., Salas, M., López, V., cerpa, J., Herrera, P., Uribe, E. (1999) Evidence that histidine-163 is critical for catalytic activity, but not for substrate binding to Escherichia coli agmatinase. Biochem. Biophys. Res. Commun. 264:196-200.
  24. Carvajal, N., Olate, J., Salas, M., Uribe, E., López, V., Herrera, P., Cerpa, J. (1999) Chemical modification and site-directed mutagenesis of human liver arginase: Evidence that the imidazole group of histidine-141 is not involved in substrate binding. Arch. Biochem. Biophys. 371:202-206.
  25. Carvajal, N., Uribe, E., López, V., Salas, M., Muller, D., Celis, R., Guzmán, J.Chemical  Modification of Genipterus maculatus arginase by Woodwards reagent K and dietil piro carbonate: evidence for an essential carboxilate and a nonessential albeit important histidine residue (1997)  Comp. Biochem. Physiol. 118B:633-637.
  26. Carvajal, N., Enríquez, S., Salas, M., Uribe, E. (1997) A critical histidine residue in arginase from Phaseolus vulgaris. Phytochemistry. 46:1327-1329.
  27. Carvajal,N., Uribe, E., Sepúlveda, M., Mendoza, C., Fuentealba, B. and  Salas, M.(1996) Chemical modification of Semele solida arginase by diethyl pyrocarbonate: evidence for a critical histidine residue. Comp. Biochem. Physiol. 114B: 367-370
  28. Carvajal,N., Uribe, E. and Salas, M. (1996) Inactivation of human liver arginase by diethyl pyrocarbonate  and   protection afforded by borate. Biochem.  Arch. 12:19-26.
  29. Carvajal, N., Torres, C.,  Uribe, E. and Salas, M. (1995) Interaction of arginase with metal ions: studies of the  enzyme from human liver and comparison with other arginases. Comp. Biochem. Physiol.112:153-159.
  30. Carvajal,N., Olave,N., Salas,M., Uribe, E. and Enríquez, S. (1995) Properties  of   an arginase  from  the cotyledons of  Phaseolus vulgaris. Phytochemistry  41:373-376.
  31. Carvajal; N. and Uribe, E. (1995) Attempted   reactivation  after   inactivation   of   rat   liver   arginase  by guanidinium chloride: studies with soluble and inmobilised species. Biochem.  Arch . 11:95-101.
  32. Carvajal, N., Uribe, E  and Torres, C (1994) Subcellular  localization, metal ion requirement and kinetic propierties of arginase from the gill tissue of the bivalve Semele solida. Comp. Biochem. Physiol. 109B:683-689.

Laboratorio

La Dra. Uribe es investigadora principal en el Laboratorio de Enzimología de nuestra Facultad de Ciencias Biológicas

Equipo conformado por:

  • Docentes: Profesora E. Amparo Uribe P y Nelson Carvajal B.
  • Alumnos:
    • José Rodolfo Benitez S (Tesista del Doctorado en Cs. Biológicas)
    • Arlette González (Tesista Magíster en Bioquímica y Bioinformática).
    • Luis Arriagada (Tesista de la carrera de Biología)
    • María Belén Reyes, Bastián Arancibia, Kelly Mella e Ignacio Martínez (Unidades de Investigación)

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      Laboratorio de Enzimología de la Facultad de Ciencias Biológicas de la Universidad de Concepción